Las herejías, antiguas si bien no representaban un serio peligro para la Iglesia , y por tanto los cátaros iban adquiriendo adeptos a su doctrina, el mundo medieval, seguía su curso, eso no significa que no hubieran ya persecuciones en tiempos de Carlomagno , no obstante los cátaros vivian en el aspecto social, con gran libertad de movimientos, puesto que otras herejías preocupaban mas, de momento, pero con el crecimiento de adeptos a los cátaros , ya el Papa Lucio II , junto con el Emperador Barba Roja , por el año 1184 empezaron a preocuparse, pronunciándose contra las nuevas religiones entre ellas los cátaros , hasta que el Papa Inocencio III , fundó la Inquisición como arma religiosa, iniciándose la persecución de los cátaros de forma mas activa, con la total adhesión al papa, del rey de Francia Felipe Augusto .
El papa Inocencio III , pronto se dio cuenta, del auge que iban adquiriendo los cátaros , puesto que su tolerante doctrina, era bien recibida tanto por el pueblo llano como por la burguesía y grandes señores, viendo en los cátaros una oposición frente al dogmatismo católico, y la posibilidad en cierta independencia de Roma, que naturalmente Inocencio III , no veía con buenos ojos, escapándosele la autoridad sobre el Languedoc, por interferencia de los cátaros , a los que se propuso eliminar físicamente, sobre cualquier otro problema, que en esos momentos tuviera pendiente de resolver.
A pesar de las amenazas de Inocencio III proferidas, contra Ramón VI de Tolosa este hizo caso omiso, incluso habiéndole dado el papa a Pedro I de Aragón el título de “El Católico”, por su ferviente religiosidad, le retiró su favor al ver su inclinación, o por lo menos simpatía hacia la causa de los cátaros .
No ve Inocencio III otra solución, contra los cátaros , que la convocatoria de una cruzada, con el poyo del rey de Francia Felipe Augusto , a fin de erradicar totalmente la doctrina de los cataros , creando para ello la Inquisición , que tras ir derrotando las plazas de los cátaros , serian sus Perfectos, Buenos Hombres, y simpatizantes, acusados de herejes, confiscando sus bienes, desterrando a sus gentes y familias, o lo que mas frecuente se llevó a cabo, condenados los cátaros a morir en la hoguera, hasta su total extinción.
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